Окрестности села Зарубино необычайно богаты археологическими памятниками, дающими яркое представление о далеком прошлом жителей нашего края. Это памятники эпохи палеолита, неолита, бронзы и средневековья.

Всего зафиксировано в селе и его окрестностях 19 памятников.

1. Деревенская гора — могильник (бронзовый век). Пункт 1 находится в 7 км к ЮВ от села, в 1,5 км ниже железнодорожного моста через р. Селенгу, на её левом берегу, у основания крутого мыса. Из 7 могил в настоящее время сохранились 2. Находки: разрозненные кости человека, обломки перламутровой раковины. Пункт 2 — в 1 км выше по течению р. Селенги. Открыт в 1947 г. А. П. Окладниковым, им же были раскопаны 2 могилы. Коллекции хранятся в ИАиЭ СО РАН.

2. Деревенская гора — петроглифы (бронзовый век). Находятся на левом берегу р. Селенги, в 7 км на ЮВ от села, в 2 км от железнодорожного моста через р. Селенгу. Рисунки располагаются на вертикальных плоскостях юго-западного склона. Выполнены светло-розовой, красной, малиновой, коричневой краской. Рисунки расположены 3 группами. Изображения состоят из антропоморфных фигурок, точек, трезубцев, елочек, оградок и птиц, расположенных рядами. Зафиксированы в 1947 г. А. П. Окладниковым.

3. Цохойтой — могильник (средневековье). Находится на левом берегу р. Селенги, в 1 км к западу от села, юго-западнее современного кладбища, в местности Цохойтой, на песчаных выдувах. Могилы на поверхности отмечены каменными кладками овальной и круглой формы размерами от 3 до 6,5 м, высотой до 0,5 м, под которыми на глубине от 0,8 до 1,5 м в дощатых гробах или колодах находились костяки в вытянутом положении или на боку. Ориентированы головой на запад, север. Находки: железные наконечники стрел, огнива, кремень, предметы из кости. У головы или слева от гробовища стояла кость ноги барана. Открыт Г. Ф. Дебецем в 1925 г., им же частично раскопан.

4. Зарубинский — могильник (средневековье). Находится в 1,5-2 км на ЮЮ-В от села в 70 м к ЮЗ от ж/д столба 5870-5869. Зафиксированы 4 сильно задернованные каменные кладки. Памятник открыт в 1992 г. группой по инвентаризации (рук. С. В. Данилов).

5. Зарубино — стоянка (палеолит). Расположена на левом берегу р. Селенги, в 4 км к ЮВ от села, рядом с железнодорожным полотном на протяжении 2 км к востоку. Подъемный материал: каменные орудия, нуклеусы, массивные отщепы, ножевидные пластины, скребки, скребловидные и нуклевидные орудия, фаунистические остатки, скорлупа яиц страуса. Открыта и обследована А. П. Мостицем в 90-х гг. XIX в. В 1926 г. на выдувах побывал П. С. Михно. В 1928-29 гг. стоянку обследовал Г. П. Сосновский. В 1947 г. осматривался А. П. Окладниковым. Коллекции хранятся в Кяхтинском краеведческом музее им. академика В. А. Обручева, в Государственном Эрмитаже, в ИАиЭ СО РАН.

6. Ивашка — стоянка (палеолит). Находится на левом берегу р. Селенги в 8 км от с. Зарубино, в 3 км выше с. Усть-Кяхты, в местности Ивашка, на террасовидной возвышенности на песках. Находки: нуклеусы-скребки, призматические пластинки из яшмовидных пород. Зафиксировано в 1887 г. А. П. Мостицем, в 1927 г. здесь производил сбор археологического материала Г. П. Сосновский, в 1948 г. — А. П. Окладников.

7. 314 км — стоянка (палеолит). Находится в 7 км от с. Зарубино за железнодорожным мостом на пологом склоне небольшой долины, открывающейся на левый берег р. Селенги. Подъемные сборы представляют грубо-призматический нуклеус, боковое выпуклое скребло, пластины. Открыт в 1947 г. БМАЭ (рук. А. П. Окладников).

8. Дюрбены — стоянка (палеолит). Находится на левом берегу р. Селенги, напротив с. Усть-Кяхта, в районе бывшего п. Дюрбены, в 3 км ниже 314 км. Находки: призматические и клиновидные нуклеусы, ножевидные пластины, наконечники листовидной формы, отщепы. Зафиксирован в 1887 г. А. П. Мостицем. Обследовался А. П. Окладниковым в 1948 г.

9. Бага-Заря — петроглифы (бронзовый век). Находятся в 3 км к югу-юго-востоку от села к западу от железной дороги на горе Бага-Заря. На плоскостях были выбиты изображения козлов, оленей, верблюдов, солярные знаки, схематические человеческие фигуры и др. Всего зафиксированы 84 рисунка, в настоящее время сохранились не более 10. Открыты в 1948 г. Р. Ф. Тугутовым. В 1949 г. и последующие годы неоднократно посещал А. П. Окладников. В 1977 г. — группа по инвентаризации (рук. Е. А. Хамзина).

10. Бага-Заря — могильник (средневековье). Находится в 3,5-3,7 км к югу-юго-востоку от села, в 0,7 км юго-восточнее петроглифов, в 0,3 км западнее железной дороги, среди песчаных увалов. Количество кладок не определено. Памятник открыт в 1992 г. группой по инвентаризации (рук. С. В. Данилов).

11. Дюрбены — могильник (бронзовый век). Находится на левом берегу р. Селенги в 0,5 км от бывшего Дюрбенского хутора. Группа 1-8 плиточных могил расположены в 30 м от берега р. Селенги. Группа II — в 0,5 км от первой группы на небольшой возвышенности у берега реки. Ю. Д. Талько-Грынцевич отмечал, что плиточные могилы в этом месте утратили свой первоначальный вид и представляли кучу камней, часть которых упала в реку. Находки: фрагменты серого сосуда с круговой орнаментацией и с рубчатым валиком. Открыт в 1897 г. Я. Е. Смолевым и Ю. Д. Талько-Грынцевичем, раскопаны могилы в первой группе. Материалы хранятся в Кяхтинском краеведческом музее им. академика В. А. Обручева.

12. Оргойтон I — гуннский могильник с княжеским курганом (железный век). Находится на левом берегу р. Селенги, в 6 км от бывшего хутора Дюрбены, в 5 км от с. Зарубино, в 2 км к западу от ж/д моста, в пади Оргойтон, устьем открывающейся к р. Селенге. В 1897 г. были отмечены 4 крупных кургана, с дромосом с южной стороны, 14 малых, кольцевых или подквадратных кладок. Находки: костяные накладки на лук (срединные и концевые), куски красной истлевшей ткани, бесформенные обломки железных предметов, фрагменты красноглиняной керамики с круглыми отверстиями. Открыт в 1897 г. Ю. Д. Талько-Грынцевичем, раскопана 1 могила. Материалы хранятся в Кяхтинском краеведческом музее им. академика В. А. Обручева.

13. Оргойтон II — могильник (бронзовый век). Находится в 4 км к югу от села, в 1 км к северу-северо-востоку от хуннского могильника Оргойтон I, на вершине скалистой сопки расположен херексур с круглой оградкой и розетками с восточной стороны, ниже по склону отмечена плиточная могила. Памятник открыт в 1992 г. группой по инвентаризации (рук С. В. Данилов).

14. Оргойтон III — петроглифы (бронзовый век). Находятся на левом берегу р. Селенги, в 1 км выше железнодорожного моста через р. Селенга на отвесной скале, на высоте 3 м от подножия скалы. Рисунки плохой сохранности, выполнены красной краской и состоят из бесформенных пятен. Открыты А. П. Окладниковым в 1949 г. Окладников, Запорожская, 1969

15. Нижняя Чонда — могильник (железный век). Находится в 6 км к юго-западу от села, в 10,15 км на запад от ОТФ Нижняя Чонда, выше по склону на безлесом взгорке. Могильник стоит из 7-8 задернованных кладок, напоминающих хуннские. Памятник открыт в 1992 г. группой по инвентаризации (рук. С. В. Данилов).

16. Ургун-Хундуй (Широкая падь) — херексуры (бронзовый век). Находятся на левом берегу р. Селенги, от села на юго-восток, в 5 км выше горы Махай, Зафиксировано 19 херексуров, до 10-15 м в диаметре, с прямоугольными и круглыми оградками, с круглыми ритуальными кладками с восточной стороны оградок. Одна плиточная могила, имеющаяся в могильнике, расположена с северной стороны одного из херексуров. Могильник зафиксирован в 1948 г. Н. Н. Диковым и Р. Ф. Тугутовым.

17. Тулду-Дабан — погребение (неолит). Находилось в 3 км от села ив 1,5 км от берега реки, на песчаных выдувах. Погребение разрушено. Костяк лежал головой на север на правом боку с согнутыми руками и ногами. В средней части могилы — красное пятно. Находки: 6 кремневых наконечников стрел, кремневая пила, ножевидные пластинки, скребок, каменный молоток, обломки речной раковины, роговая накладка на лук. Обнаружено Ю. Д. Талько-Грынцевичем в 1901 г. Материалы хранятся в Кяхтинском краеведческом музее им. академика В. А. Обручева.

18. Худжир — петроглифы (бронзовый век). Находятся на левом берегу р. Селенги выше с. Зарубино напротив с. Усть-Кяхта. Пункт 1 — в пади Худжир, на скале отмечены 3 рисунка: две пары параллельных линий, антропоморфные фигуры и пятна. Пункт 2 (Зарубино — Худжир) находится в 0,5 км ниже по течению реки от Худжир I, по дороге к бывшей паромной переправе на разрушенной скале. Рисунки выполнены красной краской, состоят из нескольких антропоморфных фигурок, оградки и пятен. Открыты в 1947 г. А. П. Окладниковым.

19. Памятник воинам-землякам, погибшим в годы Великой Отечественной войны (создан в 1965 г.), расположен в центре села.