В годы Великой Отечественной войны (1941-1945 гг.) школа находилась на мест здания сельской Администации по ул. Советской (ныне А. Мельникова). В 1942 г. школа горела, но не вся, а один кабинет. В остальных прожолжали учиться.

"До войны коллектив учителей был большой. Работать было радостно, но вот грянула война и нарушила все наши планы, и убила радость". (Из воспоминая Труневой А.Е.).
 
В войну организовали комсомольско-молодёжные "фронтовые" бригады. В наше была организована агитационна бригада под руководством Надежды Яковлевны Савельевой.
 
В войну было очень трудно: вся школа зодила на сбор колосков, ходили по домам, собирали золу для удобрения полей. Но до обеда шли занятия. Тетрадей и учебников, как таковых не было. Писали на газетах мкжду строчками. Писали обыкновенными перьями, так как ручки были не всех. Вместо чернил исрпользовали ч
 
сок свеклы, сажу. Для учителей было отведено поле в Кундуе, вечером они ходили жать хлеб.
 
В 1942 году во время летних каникул в школе был созданотряд из тридцати человек, разделенный на звенья. Каждый из его членов на период полевых работ решил "выработать по 75 трудодней и выполнить норму выроботки на 150%, активно участвовать в массовой и политичесой работе,выпускать стенгазту, быть бдительным и зорким".
 
В газете "Стахановец" от 3 сентября 1942 года есть заметка: "Хорошо работает на полевых работах бригада Нижнеторейской непоной школы, под руководством учительницы Нины Петровны Клевцовой. В бригаде 26 учащихся, они вырабатывали 602 трудотня". В этой же газете отмечается, что "хорошо работают на колхозных полях учащиеся Нижнеторейской школы. В течение лета в колхозах"Ворошилово", "Кирова", "Авангард"выработали 3745 трудодней. Из этого количества ученик шестого класса Чагдуров Сергей выработал 450 трудодней, мария Тютькина - 126 трудодней, Миша Сыромятников, Надя Ломухина, Филиппов и Красиковых Лука - от 80 до 86 трудодней"

В 1942 гоу в республике проходил сбор средств на строительство эскадрильи боевых самолетов. Активное участие в сборе приняли ученикии учителя Нижнеторейской неполной школы. Учащиеся собрали наличными 1146 рублей, из них Лида Гомбоевна, ученица 4-о класса внесла 40 рублей,Валя Григорьева, Петрова Маня и Аля Браун внеслиот 15 до 30 рублей. Восемь учителей школы собрали 1120 рублей, а сторож отмечается Вершининой и Савелтевой, добившихся "замечательных показателей по обучению и воспитанию детей".